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Automatiser sa comptabilité avec Pennylane : étapes, facture électronique, limites et rôle de l'expert-comptable

Pennylane réunit dans un même outil la banque, les factures, les justificatifs et la comptabilité, partagés en temps réel entre le dirigeant et son expert-comptable. Bien paramétré, il permet d'automatiser une grande partie de la comptabilité. Ce guide présente le fonctionnement de l'outil, les étapes pour automatiser vos flux, son rôle dans la facture électronique, ses limites et ce qu'apporte un expert-comptable qui l'utilise au quotidien.

Portrait de Guillaume Thomas, expert-comptable et fondateur de GT Expertise

Rédigé par Guillaume Thomas Expert-comptable et commissaire aux comptes, inscrit à l'Ordre des experts-comptables depuis plus de 10 ans. Il a fondé et dirige GT Expertise.

Portrait d'Arnaud de Pommery, responsable juridique de GT Expertise

Relu par Arnaud de Pommery Responsable juridique de GT Expertise.

Publié le 9 mars 2026, mis à jour le 2 novembre 2026.

Ce que fait Pennylane

FonctionCe qui est automatisé
Synchronisation bancaireImport quotidien des opérations de vos comptes professionnels
Factures d'achatCollecte des factures fournisseurs, lecture de leurs données et rapprochement avec les paiements
Facturation de venteDevis, factures, suivi des encaissements et relances clients
Notes de fraisPhoto des justificatifs, saisie et validation
ComptabilitéGénération des écritures à partir des opérations rapprochées et des règles de catégorisation
PilotageTableaux de bord de trésorerie, de chiffre d'affaires et de charges, mis à jour en continu

La différence avec un logiciel comptable traditionnel tient au partage : le dirigeant et le cabinet travaillent sur les mêmes données, au même moment, au lieu d'échanger des pièces une fois par mois ou par an.

Les étapes pour automatiser sa comptabilité

  1. Connecter tous vos comptes bancaires professionnels, y compris les cartes et les comptes secondaires, pour que chaque opération soit importée.
  2. Centraliser la collecte des factures d'achat : adresse de réception dédiée, connexion aux espaces clients des fournisseurs, photo des tickets.
  3. Définir des règles de catégorisation pour les opérations récurrentes, comme les loyers, abonnements, carburant ou cotisations, afin qu'elles soient comptabilisées sans intervention.
  4. Émettre vos factures depuis l'outil, pour que ventes et encaissements soient directement rapprochés en comptabilité. Voir notre article sur la facture professionnelle.
  5. Traiter les opérations sans justificatif chaque semaine plutôt qu'en fin d'année : c'est le principal gain de temps.
  6. Suivre les tableaux de bord de trésorerie et de chiffre d'affaires, et faire le point régulièrement avec votre expert-comptable.
Une comptabilité automatisée, mais fiable Paramétrage de Pennylane, règles de catégorisation, collecte des justificatifs, facture électronique, tableaux de bord et clôture des comptes : nous accompagnons nos clients sur l'outil au quotidien.

Pennylane et la facture électronique

Pennylane figure sur la liste officielle des plateformes agréées de facturation électronique publiée par l'administration fiscale. Ses utilisateurs peuvent donc l'utiliser pour recevoir leurs factures électroniques, obligation en vigueur pour toutes les entreprises assujetties à la TVA depuis le 1er septembre 2026, puis pour les émettre, obligation applicable aux PME, TPE et micro-entreprises à partir du 1er septembre 2027.

Un avantage pratique : lorsque la même plateforme sert à recevoir les factures et à tenir la comptabilité, les factures fournisseurs arrivent directement dans la comptabilité, avec des données structurées, sans ressaisie. Il reste à déclarer votre adresse de facturation électronique dans l'annuaire et à vérifier vos mentions de facturation. Voir notre page sur la facturation électronique.

Ce qui reste à faire à la main

  • Fournir les justificatifs : l'automatisation ne dispense pas de l'obligation de disposer d'une pièce pour chaque opération.
  • Contrôler les catégorisations proposées automatiquement, en particulier pour la TVA déductible, les dépenses mixtes et les immobilisations.
  • Gérer les opérations de clôture : stocks, amortissements, provisions, charges et produits à rattacher à l'exercice. Elles relèvent du travail de l'expert-comptable.
  • Gérer la paie, qui passe par un logiciel distinct, dont les écritures sont ensuite intégrées à la comptabilité.

Une automatisation mal paramétrée reproduit les erreurs à grande échelle : une mauvaise règle de catégorisation peut fausser la TVA ou le résultat sur toute une année.

Pennylane est-il adapté à votre entreprise ?

ProfilIntérêt de Pennylane
TPE et PME avec de nombreuses opérations bancaires et facturesÉlevé : forte automatisation et vision en continu
Startups et entreprises en croissanceÉlevé : pilotage de la trésorerie et reporting aux investisseurs
Professions libérales et sociétés de servicesBon, notamment pour la facturation et le suivi des encaissements
Très petites structures avec peu d'opérationsPlus limité : un outil plus simple peut suffire
Activités avec une gestion de stocks complexeÀ compléter par un logiciel de gestion spécialisé

Le rôle de l'expert-comptable

  • Paramétrer l'outil dès le départ : plan comptable, règles de catégorisation, régime de TVA, connexions bancaires.
  • Contrôler et corriger les écritures au fil de l'eau, plutôt qu'en fin d'exercice.
  • Établir les déclarations de TVA et les comptes annuels, et assurer la conformité fiscale.
  • Exploiter les données : tableau de bord, analyse des marges, prévisionnel et suivi de la trésorerie. Voir nos articles sur le prévisionnel financier et le besoin en fonds de roulement.

Le coût de l'outil dépend de la taille de l'entreprise, des modules utilisés et, le cas échéant, de l'offre du cabinet qui accompagne l'entreprise : l'accès à Pennylane peut être intégré à la mission d'expertise comptable.

Votre comptabilité sur Pennylane avec GT Expertise Mise en place, paramétrage, formation de vos équipes, facture électronique, tableaux de bord et analyse de vos chiffres : un cabinet d'expertise comptable en Île-de-France pour une comptabilité de pilotage.

Vos questions sur Pennylane

Qu'est-ce que Pennylane ?

Une plateforme de gestion financière et comptable qui centralise la banque, les factures, les justificatifs et la comptabilité, partagée en temps réel entre l'entreprise et son expert-comptable.

Pennylane est-il une plateforme agréée pour la facture électronique ?

Oui. Pennylane figure sur la liste officielle des plateformes agréées publiée par l'administration fiscale : il peut être utilisé pour recevoir et émettre des factures électroniques.

Pennylane remplace-t-il l'expert-comptable ?

Non. Il automatise la collecte et l'enregistrement des opérations, mais le contrôle des écritures, les opérations de clôture, les déclarations fiscales et les comptes annuels relèvent de l'expert-comptable.

Comment automatiser sa comptabilité avec Pennylane ?

En connectant tous ses comptes bancaires, en centralisant la collecte des factures d'achat, en définissant des règles de catégorisation pour les opérations récurrentes, en facturant depuis l'outil et en traitant chaque semaine les opérations sans justificatif.

Pennylane gère-t-il la paie ?

La paie est en principe établie avec un logiciel spécialisé distinct, dont les écritures sont ensuite intégrées à la comptabilité.